USP
Universidade de São Paulo

Sequenciamento Capilar

SERVIÇO DE SEQUENCIAMENTO DE DNA (método Sanger)      FÉRIAS: 19/12/2016 A 1/1/2017

O Serviço de Sequenciamento de DNA (SSDNA) está em funcionamento desde setembro de 2002 no Departamento de Bioquímica – Instituto de Química USP (IQ) sob a responsabilidade da Profa. Dra. Suely Lopes Gomes. A partir de 23 de novembro de 2016  ele passou  a pertencer à Central Analítica do IQ, não alterando em nada a rotina do SSDNA.

Está disponível para usuários do Instituto de Química, demais unidades da USP e outras Instituições de ensino e pesquisa brasileiras.

Utilizamos sequenciadores ABI PRISM® 3130XL GeneticAnalyzer /HITACHI (16 capilares, 50 cm), instalados no Bloco 12 inferior, sala 1211.


PARA UTILIZAR O SERVIÇO:

  • Agendar pelo e-mail seqdnaiq@iq.usp.br com a especialista responsável e aguardar um comunicado para a orientação de entrega das amostras.
  • As amostras deverão ser preparadas cuidadosamente pelos usuários, utilizando “kits” comerciais de preparação e purificação de DNA e, em caso de dúvida, para a reação de sequenciamento e precipitação das amostras, utilizar protocolos sugeridos pelo Serviço.
  • O fluoróforo que deverá ser utilizado na reação de sequenciamento é o BigDye®Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit da Applied Biosystems.
  • Não há número mínimo de amostras, mas se o número de amostras entregues for menor do que 16 amostras, estas deverão esperar para completar uma corrida (16 amostras).
  • Os resultados serão enviados ao usuário por e-mail no formato .ab1 e no formato  .seq,  e poderão ser analisados utilizando os programas Chromas, BioEdit ou Sequence Scanner (“softwares” de análise de sequência obtidos gratuitamente na internet).
  • O valor por amostra é de R$7,00.

COMO EFETUAR O PAGAMENTO:

  • Via Fundação da Universidade de São Paulo (FUSP) com nf-e e boleto bancário.
  • Envie os seguintes dados para o SSDNA:
  • Nome
  • CPF
  • Endereço com CEP
  • Telefone
  • E-mail
  • Valor a ser pago
  • Número do projeto (FAPESP ou CNPq)


Especialistas responsáveis pelo Serviço:

Wilton José da Rocha Lima e Adriana Yamaguti Matsukuma

e-mail do SSDNA: seqdnaiq@iq.usp.br

Telefone: 11 3091-3212 R-19

Instituto de Química USP

Av. Prof. Lineu Prestes, 748 - BLOCO 12 sala 1211

CEP 05508-000 São Paulo - SP