SERVIÇO DE SEQUENCIAMENTO DE DNA (método Sanger) FÉRIAS: 19/12/2016 A 1/1/2017
O Serviço de Sequenciamento de DNA (SSDNA) está em funcionamento desde setembro de 2002 no Departamento de Bioquímica – Instituto de Química USP (IQ) sob a responsabilidade da Profa. Dra. Suely Lopes Gomes. A partir de 23 de novembro de 2016 ele passou a pertencer à Central Analítica do IQ, não alterando em nada a rotina do SSDNA.
Está disponível para usuários do Instituto de Química, demais unidades da USP e outras Instituições de ensino e pesquisa brasileiras.
Utilizamos sequenciadores ABI PRISM® 3130XL GeneticAnalyzer /HITACHI (16 capilares, 50 cm), instalados no Bloco 12 inferior, sala 1211.
PARA UTILIZAR O SERVIÇO:
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Agendar pelo e-mail seqdnaiq@iq.usp.br com a especialista responsável e aguardar um comunicado para a orientação de entrega das amostras.
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As amostras deverão ser preparadas cuidadosamente pelos usuários, utilizando “kits” comerciais de preparação e purificação de DNA e, em caso de dúvida, para a reação de sequenciamento e precipitação das amostras, utilizar protocolos sugeridos pelo Serviço.
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O fluoróforo que deverá ser utilizado na reação de sequenciamento é o BigDye®Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit da Applied Biosystems.
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Não há número mínimo de amostras, mas se o número de amostras entregues for menor do que 16 amostras, estas deverão esperar para completar uma corrida (16 amostras).
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Os resultados serão enviados ao usuário por e-mail no formato .ab1 e no formato .seq, e poderão ser analisados utilizando os programas Chromas, BioEdit ou Sequence Scanner (“softwares” de análise de sequência obtidos gratuitamente na internet).
- O valor por amostra é de R$7,00.
COMO EFETUAR O PAGAMENTO:
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Via Fundação da Universidade de São Paulo (FUSP) com nf-e e boleto bancário.
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Envie os seguintes dados para o SSDNA:
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Nome
- CPF
- Endereço com CEP
- Telefone
- Valor a ser pago
- Número do projeto (FAPESP ou CNPq)
Especialistas responsáveis pelo Serviço:
Wilton José da Rocha Lima e Adriana Yamaguti Matsukuma
e-mail do SSDNA: seqdnaiq@iq.usp.br
Telefone: 11 3091-3212 R-19
Instituto de Química USP
Av. Prof. Lineu Prestes, 748 - BLOCO 12 sala 1211
CEP 05508-000 São Paulo - SP