USP
Universidade de São Paulo

Aline Maria da Silva

Professor Titular - Departamento de Bioquímica
3091-2182 
 almsilva@iq.usp.br

Bioquímica, Biologia Molecular e Genômica de Microorganismos 

 

A principal linha de pesquisa desenvolvida em meu grupo tem como objetivo compreender como a bactéria Xylella fastidiosa (Xf) coloniza e causa doenças em plantas hospedeiras suscetíveis, tais como laranjeiras e videiras. Usamos abordagens bioquímicas, de biologia molecular e genômicas para investigar os mecanismos que as cepas Xf evoluíram para interagir com plantas hospedeiras diversas. Os projetos que atualmente estamos desenvolvendo visam compreender a base molecular da especificidade de cepas Xf pelos distintos hospedeiros e a obtenção de dados de alta-resolução do transcriptoma dessas cepas quando expostas a diferentes condições de crescimento. Também estamos investigando as respostas primárias das plantas frente à infecção com as diferentes cepas de Xf.

O estudo da diversidade microbiana envolvida na degradação de biomassa durante o processo de compostagem foi recentemente incorporado aos meus interesses de pesquisa. Em um projeto colaborativo, estamos gerando dados metagenômicos de amostras coletadas da unidade de compostagem instalada no Parque Zoológico de São Paulo. Nossos objetivos são investigar bactérias cultiváveis e não-cultiváveis nestas comunidades microbianas complexas e buscar, nestes metagenomas, por novas enzimas com potencial para aplicação industrial.

 

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Publicações

*Martins,L.F. et al. Metagenomic analysis of a tropical composting operation at the São Paulo Zoo Park reveals diversity of biomass degradation functions and organisms. Plos One, 2013, in press.
*Chaves, G.A.T. et al. Iron as a regulator of virulence in plant pathogenic bacteria. In: Virulence mechanisms of plant pathogenic bacteria. 2013, in press. 
*Fogaça, A.C. et al. Effects of the antimicrobial peptide gomesin on the global gene expression profile, virulence, and biofilm formation of Xylella fastidiosa FEMS Microbiology Letters, 306:152-159, 2010.
*Zaini P.A. et al. The iron stimulon of Xylella fastidiosa includes genes for type-IV pilus and colicin V-like bacteriocins.Journal of Bacteriology, 190:2368-2378, 2008.
*Pashalidis S. et al. Whole-genome expression profiling of Xylella fastidiosa in response to growth on glucose. OMICS, A Journal Of Integrative Biology 9:77-90, 2005. 
*Koide T. et al. DNA microarray-based genome comparison of a pathogenic and a non-pathogenic strain of Xylella fastidiosa delineates genes important for bacterial virulence. Journal of Bacteriology, 186:5442-5449, 2004.