USP
Universidade de São Paulo

Antonia Tavares do Amaral

Professor Associado - Departamento de Química Fundamental
3091-9063 
 atdamara@iq.usp.br

Tel: ++55 11 3091-9063, laboratório: 3091-3846 

Formação Acadêmica: 
Bacharel em Química (1969); Mestrado, Instituto de Química da USP (1972); Doutorado, Instituto de Química da USP (1973); Livre Docente, Área Química Orgânica, Instituto de Química da USP (2003).
Pós-Doutoramento/Estágios de Pesquisa: Institut für Organische Chemie, Universidade de Colônia (1974-1975); Instituto de Biologia e Medicina, Borstel, Alemanha (1991); Instituto de Química Farmacêutica, Heidelberg, Alemanha (1991); Instituto de Química Farmacêutica, Universidade de Marburg, Marburg, Alemanha (2005) e (2006).


Linha de Pesquisa: Laboratório de QSAR e Modelagem Molecular de Compostos Bioativos 

Resumo: 

Em nosso grupo de pesquisa realizamos estudos das Relações Quantitativas entre Estrutura Química e Atividade Biológica (QSAR) usando estratégias metodológicas complementares, incluindo modelagem molecular (QSAR-3D) aplicadas ao planejamento e à compreensão do mecanismo de ação de compostos bioativos, como: antibacterianos, antichagásicos, tuberculostáticos, anestésicos locais, anti-HIV-1, aqueles envolvidos em processos redox, dentro do CEPID de Processos Redox em Biomedicina (CEPID-Redoxoma) e, mais recentemente, antivirais contra dengue e febre aftosa. Os compostos são sintetizados, adquridos e/ou as informações retiradas da literatura.

Procura-se contribuir para elucidar o(s) mecanismo(s) de ação e, fazer previsões quanto às atividades biológicas de compostos ainda não sintetizados bem como propor novos alvos e estruturas, levando a compostos mais potentes e menos tóxicos.

Especial ênfase é dada ao estudo dos parâmetros físico-químicos e/ou estruturais (lipofílicos, eletrônicos, polares, estéricos, e aqueles relacionados à polarizabilidade) de compostos com atividade biológica, visando elucidar tanto a natureza de cada parâmetro estrutural responsável pela atividade bem como o(s) mecanismo(s) das interações expressas por cada um dos parâmetros.
 

Técnicas quimiométricas estão sendo utilizadas e diversos procedimentos virtuais baseados nas estrututuras do ligante (LIGAND BASED) e da proteína (STRUCTURE - BASED) estão sendo aplicados com sucesso no planejamento de compostos bioativos.

Alguns dos compostos planejados como antichagásicos e como antimicrobianos estão em fase de transferência para meio produtivo (2 PATENTES).
 

É importante ressaltar que no grupo todos os procedimentos virtuais, realizados por cálculo e envolvendo modelagem molecular estão sendo acompanhados de sua validação experimental.


Produção científica:

Currículo (Sistema Lattes - CNPq) 

Currículo (Sistema Researcher ID) 

 

Publicações:


Malvezzi, A.; Queiroz, R.F.; Rezende, L.; Augusto, O.; Amaral, A.T-do. (2011), MPO inhibitors selected by virtual screening. Molecular Informatics, v. 30, p. 605–613. 

Malvezzi, A.; Amaral, A.T.-do. (2010), Ion Pair Stabilization Effects On a Series of Procaine Structural Analogs, Eur. J. Pharm Sciences, v. 41, p. 631–635.

Cheffer, A. ; Mustafa, E. V.; Amaral, A. T.-do ; Ulrich, H. (2012),. Lipophilicity as a determinant of binding of procaine analogs to rat alfa3beta4 nicotinic acetylcholine receptor. Journal of Neuroscience Research, v. 90, p. 1607-1614.
 

Malvezzi, A.; Amaral, A.T.-do; Rezende, L.de; Higa, P.M.; Souza, G.M.; Gozzo, F.C.; Ferro, E.S.; Castro, L. M.; Demasi, M. (2012), The cysteine-ich protein thimet oligopeptidase as a model of the structural requirements for S-glutathiolation and oxidative oligomerization. Plos One, v. 7, p. 1-11.
 

Ishiki, H.M.; Amaral, A.T-do. (2009), Three-Dimensional Quantitative Structure-Activity Relationship Study of Antitumor 2-Formylpyridine Thiosemicarbazones Derivatives as Inhibitors of Ribonucleotide Reductase, QSAR & Combinatorial Science, v. 28, p. 1334-1345.
 

Queiroz, R.F.; Jordão, A.K.; Cunha, A.; Ferrreira, V.; Brigagão, M.R.P.L.; Malvezzi, A.; Amaral, A.T.-do; Augusto, O. (2012), Nitroxides attenuate carrageenan-induced inflammation in rat paws by reducing neutrophil infiltration and the resulting myeloperoxidase-mediated damage. Free Radical Biology & Medicine, v. 53, p. 1942-1953.

Malvezzi, A.; Rezende, L. de; Amaral, A.T.-do. (2009), Pharmacophore Model of Cruzain Inhibitors, QSAR & Combinatorial Science, v. 8, p. 781-784.

Malvezzi, A., Rezende, L., Izidoro, M.A., Cezari, M.H.S., Juliano, L.; Amaral, A.T.-do. (2008), Uncovering false positives on a virtual screening search for cruzain inhibitors, Bioorg. Med. Chem. Lett., v. 18(1), p. 350-354.

Capitulo de Livro ( Book Proceedings) Malvezzi, A.; Rezende, L. de; Izidoro, M.A.; Cezari, M.H.S; Juliano, L and Amaral, A.T.-do; Promiscuous mechanism in a virtual screening search for inhibitors of cruzain, a cysteine protease of Trypanosoma cruzi, Book of proceedings of the International Conference on Drug Design and Discovery for Developing Countries (Trieste 3 - 5 July 2008), ICS-UNIDO publication;
 

Pires, J.R.; Saito, C.; Gomes,S.L.; Giesbrecht, A.; Amaral, A.T.-do. (2011), Investigation of 5-Nitrofuran Derivatives: Synthesis, Antibacterial Activity and Quantitative Structure-Activity Relationships, J. Med. Chem., v. 44(22), p. 3673-3681.

Rando, D.G.; Sato, D.N.; Siqueira, L.; Malvezzi, A.; Leite,C.Q.F.; Amaral,A.T.-do; Ferreira, E.I.; Tavares, L.C. (2002), Potential Tuberculostatic Agents. Topliss application on benzoic acid [(5-nitro-thiophen-2-yl)-methylene]-hydrazide series, Biorg. Med. Chem, v. 10(3), p. 557-560.

Trossini, G.H.G.; Giarola J.; Rezende, L.; do-Amaral, A.T.; Zaim, M.H.; Bruns, R.E; Ferreira, E.I.. (2010), Synthesis Optimization of Hydroxymethylnitrofurazone, an Antichagasic Candidate, Using 32 Factorial Design, Letters in Organic Chemistry, v. 7, p. 191-195.